создаётся Минсельхозом России. Основными задачами подсистемы являются: участие в разработке и осуществлении государственных, ведомственных целевых и научно-технических программ в области защиты организаций (объектов) агропромышленного комплекса от ЧС; организация и осуществление мероприятий по предупреждению и ликвидации ЧС в организациях (на объектах) агропромышленного комплекса; обеспечение готовности органов, сил подсистемы к выполнению задач по предупреждению и ликвидации ЧС в организациях (на объектах) агропромышленного комплекса; взаимодействие с МЧС России, его территориальными органами и другими заинтересованными федеральными органами исполнительной власти по вопросам защиты организаций (объектов) агропромышленного комплекса от ЧС, совершенствования функционирования подсистемы.